Большим реорганизациям подвергается в ходе административной реформы управление в области охраны окружающей среды. Более года функционируют два федеральных органа природного контроля и экологического надзора и находящиеся в ведении МПР России федеральные агентства по недропользованию, лесного хозяйства, водных ресурсов. Общество ищет способы разграничения их компетенции и налаживания эффективной работы, равно как и полномочий в экологической сфере между Федерацией, субъектами Федерации и муниципальными образованиями (см.: С.А. Боголюбов, Н.В. Кичигин, А.Ю. Семьянова и др. Федеральный государственный экологический контроль. М.: Проспект, 2005). Координация и взаимодействие между этими элементами и звеньями экологического управления являются сегодня основной задачей науки и практики, от решения которой зависит эффективность природоохранного организационного, идеологического, экономического и правового механизма.

Известно, что право безмолвствует без потенциальной возможности привлечения к соответствующим видам ответственности - дисциплинарной, гражданско-материальной, административной и уголовной. В этом контексте важна лекция об ответственности за экологические правонарушения. На счету А.Ю. Семьяновой заявление и выигрыш судебных и арбитражных исков в защиту общественных интересов и окружающей природной среды, что также повышает теоретический авторитет и практический вес написанного ею.

Эффективность юрисдикционного механизма, т.е. системы рассмотрения споров, выявления составов правонарушений и виновных, наложения и исполнения справедливого наказания за экологические правонарушения остаются пока слабым местом природоохранной деятельности. Не случайно Федеральным законом от 9 мая 2005 г. N 45-ФЗ КоАП РФ дополнен статьей 3.12 "Административное приостановление деятельности", которое заключается во временном прекращении деятельности физических и юридических лиц, эксплуатации агрегатов, объектов, зданий или сооружений, осуществления отдельных видов деятельности, работ, оказания услуг. Этот вид административного воздействия может назначаться судьей в случае угрозы жизни или здоровью людей, причинения существенного вреда состоянию или качеству окружающей среды.